Дополню: перемещение из одного долга в другой в бюджете не отражается никак. Ни в сводном, ни в свободном.

С одной стороны это вроде бы логично, но с другой стороны, для текущей реализации бюджета оно несколько неожиданно. :)

Я бы добавил, что и произвольные операции тоже криво отражаются

А в каких случаях?

Я такого пока не видел, но ведь это надо знать, куда смотреть.

Посмотрите расчеты по долгам через универсальную операцию.

Кхм... мне тогда показалось, что долги через УО ведут себя в бюджете точно так же (так же не правильно). 

Дополнение 2.

Общение с разработчиками на эту тему успеха не имело, по их мнению все норм.

Но хоть выслушали, на том спасибо. 

У них уже давно нет хорошего методиста и грамотного постановщика, все делается на коленке и на голом энтузиазме.